Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGP37231 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGP37231 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPARGP37231 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPARGP37231 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPARGP37231 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPARGP37231 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPARGP37231 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGP37231 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGP37231 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGP37231 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGP37231 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGP37231 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGP37231 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGP37231 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGP37231 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGP37231 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGP37231 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGP37231 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGP37231 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGP37231 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPARGP37231 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPARGP37231 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPARGP37231 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms