Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD12P35452 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD12P35452 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD12P35452 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD12P35452 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD12P35452 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD12P35452 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD12P35452 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD12P35452 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD12P35452 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD12P35452 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXD12P35452 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms