Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCKBRP32239 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKBRP32239 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms