Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD1P28340 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD1P28340 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD1P28340 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD1P28340 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD1P28340 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD1P28340 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD1P28340 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD1P28340 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD1P28340 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD1P28340 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD1P28340 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD1P28340 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD1P28340 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD1P28340 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD1P28340 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD1P28340 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD1P28340 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD1P28340 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD1P28340 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD1P28340 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD1P28340 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD1P28340 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD1P28340 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD1P28340 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD1P28340 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD1P28340 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD1P28340 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD1P28340 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD1P28340 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD1P28340 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD1P28340 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD1P28340 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD1P28340 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD1P28340 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD1P28340 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD1P28340 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD1P28340 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD1P28340 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD1P28340 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD1P28340 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD1P28340 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD1P28340 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLD1P28340 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLD1P28340 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLD1P28340 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLD1P28340 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLD1P28340 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLD1P28340 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD1P28340 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD1P28340 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD1P28340 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD1P28340 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD1P28340 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD1P28340 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD1P28340 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD1P28340 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD1P28340 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD1P28340 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD1P28340 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLD1P28340 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLD1P28340 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
POLD1P28340 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLD1P28340 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLD1P28340 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLD1P28340 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLD1P28340 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLD1P28340 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD1P28340 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms