Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB9P28065 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB9P28065 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms