Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2AP24928 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms