Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPREP23469 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPREP23469 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPREP23469 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPREP23469 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPREP23469 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPREP23469 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPREP23469 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPREP23469 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPREP23469 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPREP23469 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPREP23469 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPREP23469 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPREP23469 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPREP23469 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPREP23469 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPREP23469 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPREP23469 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPREP23469 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPREP23469 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPREP23469 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPREP23469 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPREP23469 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPREP23469 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPREP23469 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPREP23469 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPREP23469 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPREP23469 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPREP23469 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPREP23469 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPREP23469 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPREP23469 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPREP23469 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPREP23469 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPREP23469 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPREP23469 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPREP23469 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPREP23469 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPREP23469 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPREP23469 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPREP23469 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPREP23469 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPREP23469 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPREP23469 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPREP23469 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPREP23469 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPREP23469 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPREP23469 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPREP23469 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPREP23469 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPREP23469 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPREP23469 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPREP23469 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPREP23469 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPREP23469 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPREP23469 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPREP23469 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPREP23469 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPREP23469 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPREP23469 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPREP23469 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPREP23469 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPREP23469 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPREP23469 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPREP23469 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPREP23469 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPREP23469 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPREP23469 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPREP23469 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPREP23469 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPREP23469 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms