Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSHP23434 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSHP23434 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GCSHP23434 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GCSHP23434 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSHP23434 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCSHP23434 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms