Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT1P21579 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT1P21579 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT1P21579 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT1P21579 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT1P21579 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT1P21579 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT1P21579 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT1P21579 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT1P21579 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT1P21579 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT1P21579 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT1P21579 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT1P21579 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT1P21579 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT1P21579 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT1P21579 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT1P21579 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT1P21579 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT1P21579 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT1P21579 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT1P21579 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT1P21579 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT1P21579 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT1P21579 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT1P21579 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT1P21579 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT1P21579 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT1P21579 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT1P21579 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT1P21579 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT1P21579 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT1P21579 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT1P21579 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT1P21579 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT1P21579 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT1P21579 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT1P21579 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT1P21579 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT1P21579 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT1P21579 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT1P21579 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT1P21579 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT1P21579 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT1P21579 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT1P21579 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT1P21579 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT1P21579 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT1P21579 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT1P21579 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT1P21579 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT1P21579 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT1P21579 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT1P21579 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT1P21579 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT1P21579 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT1P21579 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT1P21579 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT1P21579 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT1P21579 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT1P21579 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT1P21579 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT1P21579 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT1P21579 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT1P21579 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms