Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP4AP20648 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms