Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PVALBP20472 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PVALBP20472 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PVALBP20472 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PVALBP20472 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PVALBP20472 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PVALBP20472 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PVALBP20472 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PVALBP20472 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PVALBP20472 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PVALBP20472 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PVALBP20472 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PVALBP20472 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PVALBP20472 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PVALBP20472 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PVALBP20472 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PVALBP20472 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PVALBP20472 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PVALBP20472 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PVALBP20472 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PVALBP20472 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PVALBP20472 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PVALBP20472 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PVALBP20472 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PVALBP20472 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PVALBP20472 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PVALBP20472 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PVALBP20472 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PVALBP20472 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PVALBP20472 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PVALBP20472 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PVALBP20472 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PVALBP20472 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PVALBP20472 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PVALBP20472 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PVALBP20472 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PVALBP20472 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PVALBP20472 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PVALBP20472 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PVALBP20472 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PVALBP20472 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PVALBP20472 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PVALBP20472 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PVALBP20472 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PVALBP20472 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PVALBP20472 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PVALBP20472 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms