Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNI1P19237 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI1P19237 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms