Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDCP19113 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDCP19113 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDCP19113 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDCP19113 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDCP19113 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDCP19113 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDCP19113 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDCP19113 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDCP19113 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDCP19113 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDCP19113 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDCP19113 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDCP19113 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDCP19113 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDCP19113 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDCP19113 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDCP19113 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDCP19113 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDCP19113 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDCP19113 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDCP19113 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDCP19113 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDCP19113 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDCP19113 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDCP19113 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDCP19113 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDCP19113 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDCP19113 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDCP19113 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDCP19113 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms