Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PGAM1P18669 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGAM1P18669 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms