Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC2P18074 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERCC2P18074 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms