Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA1P17302 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA1P17302 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA1P17302 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA1P17302 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA1P17302 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA1P17302 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA1P17302 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA1P17302 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA1P17302 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA1P17302 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA1P17302 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJA1P17302 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA1P17302 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA1P17302 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA1P17302 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA1P17302 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA1P17302 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA1P17302 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA1P17302 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA1P17302 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA1P17302 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA1P17302 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA1P17302 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJA1P17302 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJA1P17302 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GJA1P17302 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GJA1P17302 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA1P17302 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA1P17302 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA1P17302 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA1P17302 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA1P17302 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA1P17302 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA1P17302 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA1P17302 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA1P17302 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA1P17302 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA1P17302 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJA1P17302 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA1P17302 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA1P17302 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms