Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A2P16615 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms