Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUC1P15941 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUC1P15941 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUC1P15941 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUC1P15941 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUC1P15941 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUC1P15941 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUC1P15941 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUC1P15941 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUC1P15941 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUC1P15941 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MUC1P15941 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MUC1P15941 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MUC1P15941 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MUC1P15941 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MUC1P15941 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MUC1P15941 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MUC1P15941 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MUC1P15941 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MUC1P15941 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MUC1P15941 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MUC1P15941 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MUC1P15941 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MUC1P15941 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MUC1P15941 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms