Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPA2P15927 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPA2P15927 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPA2P15927 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPA2P15927 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPA2P15927 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPA2P15927 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA2P15927 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA2P15927 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA2P15927 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA2P15927 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA2P15927 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA2P15927 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA2P15927 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA2P15927 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA2P15927 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA2P15927 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA2P15927 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms