Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPBP14678 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms