Protein–RNA interactions for Protein: P14317

HCLS1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1P14317 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HCLS1P14317 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HCLS1P14317 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HCLS1P14317 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HCLS1P14317 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HCLS1P14317 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HCLS1P14317 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HCLS1P14317 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HCLS1P14317 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms