Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC130P13994 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC130P13994 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms