Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A1P13866 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms