Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL5P13501 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL5P13501 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL5P13501 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL5P13501 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL5P13501 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL5P13501 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL5P13501 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL5P13501 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL5P13501 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL5P13501 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL5P13501 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL5P13501 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL5P13501 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL5P13501 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL5P13501 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL5P13501 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL5P13501 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCL5P13501 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL5P13501 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL5P13501 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL5P13501 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL5P13501 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL5P13501 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL5P13501 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL5P13501 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL5P13501 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL5P13501 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL5P13501 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL5P13501 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL5P13501 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL5P13501 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL5P13501 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL5P13501 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL5P13501 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL5P13501 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL5P13501 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL5P13501 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL5P13501 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL5P13501 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL5P13501 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL5P13501 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL5P13501 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL5P13501 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL5P13501 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL5P13501 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL5P13501 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL5P13501 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL5P13501 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL5P13501 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL5P13501 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL5P13501 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL5P13501 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL5P13501 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL5P13501 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL5P13501 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL5P13501 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL5P13501 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL5P13501 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL5P13501 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL5P13501 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL5P13501 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL5P13501 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL5P13501 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms