Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFITM1P13164 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms