Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYL4P12829 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYL4P12829 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MYL4P12829 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MYL4P12829 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYL4P12829 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYL4P12829 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYL4P12829 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MYL4P12829 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYL4P12829 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYL4P12829 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYL4P12829 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYL4P12829 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYL4P12829 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYL4P12829 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYL4P12829 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYL4P12829 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYL4P12829 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYL4P12829 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYL4P12829 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYL4P12829 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYL4P12829 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYL4P12829 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYL4P12829 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYL4P12829 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYL4P12829 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYL4P12829 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYL4P12829 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYL4P12829 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYL4P12829 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYL4P12829 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYL4P12829 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYL4P12829 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYL4P12829 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYL4P12829 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYL4P12829 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYL4P12829 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYL4P12829 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYL4P12829 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYL4P12829 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYL4P12829 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYL4P12829 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYL4P12829 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYL4P12829 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYL4P12829 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYL4P12829 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYL4P12829 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYL4P12829 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYL4P12829 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYL4P12829 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYL4P12829 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYL4P12829 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYL4P12829 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MYL4P12829 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MYL4P12829 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYL4P12829 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYL4P12829 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYL4P12829 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYL4P12829 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYL4P12829 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYL4P12829 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MYL4P12829 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYL4P12829 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYL4P12829 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYL4P12829 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYL4P12829 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYL4P12829 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYL4P12829 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYL4P12829 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms