Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN1P12814 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN1P12814 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms