Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLBP1P12271 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms