Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ODC1P11926 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ODC1P11926 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ODC1P11926 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ODC1P11926 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODC1P11926 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODC1P11926 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODC1P11926 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ODC1P11926 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODC1P11926 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODC1P11926 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODC1P11926 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODC1P11926 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODC1P11926 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODC1P11926 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODC1P11926 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODC1P11926 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODC1P11926 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODC1P11926 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODC1P11926 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ODC1P11926 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODC1P11926 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODC1P11926 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODC1P11926 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODC1P11926 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODC1P11926 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODC1P11926 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODC1P11926 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODC1P11926 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODC1P11926 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODC1P11926 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODC1P11926 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODC1P11926 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ODC1P11926 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODC1P11926 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODC1P11926 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODC1P11926 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODC1P11926 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODC1P11926 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODC1P11926 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODC1P11926 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODC1P11926 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODC1P11926 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODC1P11926 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODC1P11926 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODC1P11926 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ODC1P11926 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ODC1P11926 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODC1P11926 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODC1P11926 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODC1P11926 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms