Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM10L2AP0DMW4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM10L2AP0DMW4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms