Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228BP0C875 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM228BP0C875 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms