Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD48P09326 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD48P09326 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD48P09326 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD48P09326 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD48P09326 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD48P09326 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD48P09326 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD48P09326 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD48P09326 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD48P09326 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD48P09326 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD48P09326 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD48P09326 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD48P09326 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD48P09326 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD48P09326 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD48P09326 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD48P09326 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD48P09326 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD48P09326 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD48P09326 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD48P09326 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD48P09326 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD48P09326 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD48P09326 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD48P09326 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD48P09326 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD48P09326 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD48P09326 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD48P09326 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD48P09326 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CD48P09326 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD48P09326 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD48P09326 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD48P09326 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD48P09326 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD48P09326 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD48P09326 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD48P09326 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD48P09326 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD48P09326 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD48P09326 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD48P09326 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD48P09326 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD48P09326 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD48P09326 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD48P09326 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD48P09326 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD48P09326 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD48P09326 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD48P09326 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD48P09326 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD48P09326 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD48P09326 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD48P09326 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD48P09326 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD48P09326 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD48P09326 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD48P09326 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD48P09326 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD48P09326 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD48P09326 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD48P09326 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD48P09326 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD48P09326 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD48P09326 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD48P09326 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD48P09326 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD48P09326 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD48P09326 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD48P09326 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms