Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGAVP06756 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms