Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DOAP06340 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms