Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ITGB3P05106 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGB3P05106 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms