Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FGAP02671 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGAP02671 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGAP02671 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGAP02671 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGAP02671 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGAP02671 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGAP02671 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGAP02671 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGAP02671 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGAP02671 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGAP02671 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGAP02671 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGAP02671 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGAP02671 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FGAP02671 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGAP02671 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FGAP02671 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGAP02671 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGAP02671 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGAP02671 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGAP02671 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGAP02671 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGAP02671 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FGAP02671 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGAP02671 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGAP02671 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGAP02671 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGAP02671 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGAP02671 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGAP02671 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGAP02671 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGAP02671 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGAP02671 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGAP02671 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGAP02671 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGAP02671 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGAP02671 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGAP02671 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGAP02671 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGAP02671 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGAP02671 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGAP02671 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGAP02671 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FGAP02671 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGAP02671 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGAP02671 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGAP02671 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGAP02671 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGAP02671 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGAP02671 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms