Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24AO95486 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms