Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM37O94972 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM37O94972 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms