Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SOGA1O94964 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SOGA1O94964 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SOGA1O94964 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms