Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF6O94906 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms