Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG12O94817 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG12O94817 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG12O94817 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG12O94817 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG12O94817 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG12O94817 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG12O94817 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG12O94817 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG12O94817 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG12O94817 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG12O94817 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG12O94817 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG12O94817 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG12O94817 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG12O94817 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG12O94817 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG12O94817 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG12O94817 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG12O94817 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG12O94817 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG12O94817 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG12O94817 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG12O94817 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG12O94817 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG12O94817 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms