Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FLOT1O75955 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLOT1O75955 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms