Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF9O75901 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RASSF9O75901 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms