Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN11O75508 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN11O75508 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms