Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC43.21■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
ABCC9O60706 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC43.18■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
ABCC9O60706 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC43.1■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms