Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCRIPO60506 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNCRIPO60506 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms