Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LANCL1O43813 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms