Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH3O43739 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms