Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HTATSF1O43719 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HTATSF1O43719 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTATSF1O43719 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms