Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD6O43541 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD6O43541 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD6O43541 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD6O43541 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD6O43541 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD6O43541 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD6O43541 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD6O43541 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD6O43541 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD6O43541 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD6O43541 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD6O43541 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD6O43541 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD6O43541 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms